Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 AC134772.2-202ENST00000634384 3585 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 CYP24A1-203ENST00000395955 2227 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 AL359510.2-201ENST00000624958 2249 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 DLGAP2-201ENST00000421627 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 SP140L-203ENST00000415673 2665 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 RGS16-201ENST00000367558 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 DYNC1I2-204ENST00000409317 2196 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 CXCL5-201ENST00000296027 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 MKNK1-201ENST00000341183 2612 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 EDARADD-202ENST00000359362 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 CCDC60-201ENST00000327554 2450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 MOCS1-204ENST00000373188 3358 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 ATG10-201ENST00000282185 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 YWHAB-201ENST00000353703 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 PIGG-208ENST00000504346 3019 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 SYTL4-201ENST00000263033 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 TMEM30A-203ENST00000475111 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 MISP-201ENST00000215582 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 INIP-203ENST00000374242 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 PAX3-205ENST00000392069 3170 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 AC008764.8-201ENST00000623966 2717 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 EGFLAM-204ENST00000397202 2398 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 DFFB-205ENST00000378209 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 AGAP12P-202ENST00000603888 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 CTAGE10P-201ENST00000318353 2408 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 IQUB-202ENST00000466202 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 SARDH-204ENST00000371872 3344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 NRF1-202ENST00000311967 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 GNB5-203ENST00000396335 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2BFSP57053 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms