Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 STK16-202ENST00000409260 1493 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 MED27-202ENST00000357028 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 KRTAP12-1-201ENST00000391617 588 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 RNF7-202ENST00000393000 805 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 AC108879.1-201ENST00000438026 828 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 IGKV3-11-201ENST00000483158 392 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 AC105424.1-201ENST00000514583 209 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 AC015818.3-201ENST00000583797 589 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 AC008982.1-201ENST00000594769 963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 AC136475.1-203ENST00000602756 1034 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 AC005906.2-208ENST00000638655 1286 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 LINC00337-201ENST00000429480 1302 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 METTL22-203ENST00000561758 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 TPT1-201ENST00000309246 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 LINC02036-201ENST00000415869 910 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 SDCBP2P1-201ENST00000416115 614 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 IDI2-AS1-204ENST00000437374 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 HAX1-204ENST00000457918 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 EFNA5-204ENST00000509503 637 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 AC008808.2-201ENST00000510349 569 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 SMIM14-205ENST00000511809 830 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 AC109597.2-201ENST00000569407 927 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 LINC00514-203ENST00000573465 313 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 ARL17B-207ENST00000575960 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 AL590491.2-202ENST00000611126 418 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 CNBP-207ENST00000502976 1626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 LINC02433-202ENST00000507108 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 CACNA2D4-209ENST00000538450 1498 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 DEGS1-202ENST00000391877 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 GAPDH-205ENST00000396861 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VEGFBP49765 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms