Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC13□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC13□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC13□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC13□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC13□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
APOBEC1P41238 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms