Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 USP44-202ENST00000393091 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 SLC13A2-205ENST00000545060 1276 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 AL162731.1-201ENST00000613248 876 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KDM5AP29375 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms