Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT1P21579 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT1P21579 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT1P21579 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT1P21579 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT1P21579 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT1P21579 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT1P21579 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT1P21579 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT1P21579 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT1P21579 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT1P21579 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT1P21579 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT1P21579 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT1P21579 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT1P21579 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT1P21579 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT1P21579 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT1P21579 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT1P21579 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT1P21579 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT1P21579 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT1P21579 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT1P21579 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT1P21579 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT1P21579 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT1P21579 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT1P21579 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT1P21579 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT1P21579 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT1P21579 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT1P21579 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT1P21579 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT1P21579 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT1P21579 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT1P21579 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT1P21579 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYT1P21579 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SYT1P21579 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SYT1P21579 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT1P21579 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT1P21579 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT1P21579 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT1P21579 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT1P21579 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT1P21579 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT1P21579 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT1P21579 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT1P21579 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT1P21579 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT1P21579 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT1P21579 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT1P21579 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT1P21579 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT1P21579 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT1P21579 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT1P21579 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT1P21579 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT1P21579 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT1P21579 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT1P21579 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT1P21579 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT1P21579 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT1P21579 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT1P21579 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT1P21579 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT1P21579 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT1P21579 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT1P21579 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT1P21579 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT1P21579 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT1P21579 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT1P21579 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT1P21579 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT1P21579 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT1P21579 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT1P21579 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT1P21579 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT1P21579 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT1P21579 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT1P21579 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT1P21579 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT1P21579 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT1P21579 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT1P21579 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT1P21579 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYT1P21579 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT1P21579 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT1P21579 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT1P21579 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT1P21579 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT1P21579 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT1P21579 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT1P21579 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT1P21579 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT1P21579 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT1P21579 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT1P21579 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT1P21579 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SYT1P21579 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.5 ms