Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A1P19634 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms