Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C4BP0C0L5 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C4BP0C0L5 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C4BP0C0L5 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C4BP0C0L5 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C4BP0C0L5 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C4BP0C0L5 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C4BP0C0L5 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C4BP0C0L5 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C4BP0C0L5 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C4BP0C0L5 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C4BP0C0L5 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C4BP0C0L5 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C4BP0C0L5 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C4BP0C0L5 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
C4BP0C0L5 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
C4BP0C0L5 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
C4BP0C0L5 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
C4BP0C0L5 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
C4BP0C0L5 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 SLC13A2-205ENST00000545060 1276 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
C4BP0C0L5 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms