Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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