Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HHLA1C9JL84 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms