Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms