Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC14□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
C4orf47A7E2U8 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms