Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PPARGC1AQ9UBK2 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PPARGC1AQ9UBK2 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PPARGC1AQ9UBK2 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PPARGC1AQ9UBK2 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PPARGC1AQ9UBK2 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PPARGC1AQ9UBK2 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PPARGC1AQ9UBK2 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PPARGC1AQ9UBK2 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PPARGC1AQ9UBK2 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PPARGC1AQ9UBK2 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PPARGC1AQ9UBK2 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PPARGC1AQ9UBK2 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PPARGC1AQ9UBK2 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms