Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBA6

C6orf48, Protein G8, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48Q9UBA6 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C6orf48Q9UBA6 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms