Protein–RNA interactions for Protein: Q9P218

COL20A1, Collagen alpha-1(XX) chain, humanhuman

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Length 1,284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL20A1Q9P218 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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COL20A1Q9P218 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL20A1Q9P218 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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COL20A1Q9P218 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL20A1Q9P218 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
COL20A1Q9P218 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL20A1Q9P218 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL20A1Q9P218 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
COL20A1Q9P218 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
COL20A1Q9P218 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL20A1Q9P218 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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COL20A1Q9P218 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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COL20A1Q9P218 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL20A1Q9P218 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL20A1Q9P218 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL20A1Q9P218 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL20A1Q9P218 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms