Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PHACTR1Q9C0D0 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms