Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 DNASE1L1-205ENST00000369809 3008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 MSH6-215ENST00000622629 4324 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 S1PR1-201ENST00000305352 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 PARP3-202ENST00000417220 2472 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 EXOC8-201ENST00000366645 5100 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 ZMYND11-203ENST00000381591 4229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 DNAH10OS-201ENST00000514254 5040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 EGFR-AS1-201ENST00000442411 2806 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 POTEI-201ENST00000451531 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 TSKU-203ENST00000527881 3554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 LINC00656-201ENST00000443744 1896 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 AAGAB-207ENST00000561452 2251 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 PARN-203ENST00000437198 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 KDM2A-210ENST00000529006 6967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 ENOSF1-203ENST00000383578 4188 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 TMPRSS13-201ENST00000430170 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 TXNRD1-201ENST00000354940 4082 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 DNMT1-202ENST00000359526 5206 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 SLC25A35-203ENST00000579192 2136 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 FHOD1-201ENST00000258201 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 HS6ST1-201ENST00000259241 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 CPT1C-217ENST00000598293 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 GDPD5-202ENST00000443276 3106 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 CMC2-201ENST00000219400 10301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 BAIAP2-AS1-202ENST00000577066 4465 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 AL645608.3-201ENST00000448179 3043 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 GLUL-204ENST00000417584 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 GNPDA1-210ENST00000508177 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 FAM214B-204ENST00000378566 2566 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 DACH2-201ENST00000373125 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 DGKH-203ENST00000379274 4202 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 TNRC6C-201ENST00000301624 9632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 SCP2-203ENST00000371514 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 PDP1-202ENST00000396200 4358 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 LAIR1-204ENST00000391743 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 CPT1A-205ENST00000539743 2382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 TFDP2-215ENST00000489671 9857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 FRMD6-203ENST00000395718 4828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 SHROOM3-201ENST00000296043 11020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 ATF6B-210ENST00000375203 2620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PMCHL2Q9BQD1 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms