Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms