Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC4

ZNF479, Zinc finger protein 479, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF479Q96JC4 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 PEX12-201ENST00000225873 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 FBN1-201ENST00000316623 11756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 MATR3-227ENST00000618441 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ZNF479Q96JC4 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms