Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 ATXN2L-203ENST00000340394 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 CICP18-201ENST00000406017 2812 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 MECOM-206ENST00000464456 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 COG4-202ENST00000393612 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 ITGAX-201ENST00000268296 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 WNK1-202ENST00000340908 11208 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 PLOD3-201ENST00000223127 2920 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 SEPT10-202ENST00000397712 3071 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 WDR27-203ENST00000448612 3178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 QSOX1-202ENST00000367602 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 ADAMTSL1-205ENST00000380548 8030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 GRAMD1B-215ENST00000638086 2665 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 HLCS-207ENST00000612277 6112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 TMEM199-201ENST00000292114 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 FBF1-210ENST00000592193 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 AC237221.1-202ENST00000563054 2947 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SFT2D1Q8WV19 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 EPB41L1-206ENST00000373950 3631 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 SMARCA2-209ENST00000382203 5867 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 APOBR-201ENST00000431282 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 PM20D1-201ENST00000367136 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 SLC22A6-202ENST00000377871 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 DLGAP2-201ENST00000421627 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 GMEB2-201ENST00000266068 4559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 RAB27A-201ENST00000336787 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 DENND1C-201ENST00000381480 2816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 PAPLN-203ENST00000554301 4090 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 NR3C2-203ENST00000358102 5893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 MCM7-213ENST00000621318 3084 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SFT2D1Q8WV19 PLA1A-206ENST00000495992 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms