Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF65

GIPC2, PDZ domain-containing protein GIPC2, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC2Q8TF65 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC2Q8TF65 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms