Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
RNF148Q8N7C7 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF148Q8N7C7 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF148Q8N7C7 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF148Q8N7C7 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF148Q8N7C7 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF148Q8N7C7 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF148Q8N7C7 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF148Q8N7C7 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF148Q8N7C7 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF148Q8N7C7 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF148Q8N7C7 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF148Q8N7C7 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF148Q8N7C7 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF148Q8N7C7 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF148Q8N7C7 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF148Q8N7C7 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF148Q8N7C7 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF148Q8N7C7 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF148Q8N7C7 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF148Q8N7C7 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF148Q8N7C7 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF148Q8N7C7 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
RNF148Q8N7C7 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms