Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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ATG4DQ86TL0 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ATG4DQ86TL0 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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