Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms