Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 C2-211ENST00000469372 1906 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00538-201ENST00000626109 1906 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 MASP1-201ENST00000169293 2440 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 KCNH7-201ENST00000328032 2434 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 FYN-203ENST00000368667 2416 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 RBM39-243ENST00000528062 2421 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TSN-201ENST00000389682 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF747-201ENST00000252799 3936 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 UTP3-201ENST00000254803 2073 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 FAM189A2-202ENST00000303068 2051 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SLC22A12-204ENST00000377574 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SLC5A11-209ENST00000567758 2246 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 POLN-201ENST00000382865 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 NT5C3A-214ENST00000620705 1704 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ERN2-201ENST00000256797 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM134-201ENST00000308022 3534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00342-202ENST00000448494 2351 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 COL8A1-202ENST00000273342 3029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ABI1-212ENST00000490841 3188 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 P2RX1-201ENST00000225538 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 DBIL5P-203ENST00000536214 2677 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SLC4A11-207ENST00000539553 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 HDGF-203ENST00000368209 2171 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PAX9-202ENST00000402703 3104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 C16orf82-202ENST00000505035 2459 ntAPPRIS P5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 RBPJ-203ENST00000345843 1682 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SNU13-203ENST00000401959 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CPT1B-204ENST00000405237 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 HPSE2-201ENST00000370546 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 MAB21L2-201ENST00000317605 2772 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC037459.3-201ENST00000521025 2750 ntBASIC2.21□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CYB5R3-202ENST00000361740 2938 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms