Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 USP3-AS1-204ENST00000559861 620 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TLR1Q15399 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TLR1Q15399 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TLR1Q15399 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TLR1Q15399 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TLR1Q15399 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TLR1Q15399 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
TLR1Q15399 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
TLR1Q15399 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TLR1Q15399 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
TLR1Q15399 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
TLR1Q15399 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
TLR1Q15399 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
TLR1Q15399 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
TLR1Q15399 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TLR1Q15399 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TLR1Q15399 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TLR1Q15399 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TLR1Q15399 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TLR1Q15399 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TLR1Q15399 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TLR1Q15399 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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TLR1Q15399 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TLR1Q15399 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TLR1Q15399 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TLR1Q15399 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TLR1Q15399 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TLR1Q15399 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TLR1Q15399 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TLR1Q15399 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TLR1Q15399 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TLR1Q15399 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TLR1Q15399 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TLR1Q15399 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TLR1Q15399 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TLR1Q15399 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TLR1Q15399 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TLR1Q15399 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
TLR1Q15399 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
TLR1Q15399 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TLR1Q15399 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TLR1Q15399 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TLR1Q15399 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
TLR1Q15399 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
TLR1Q15399 ACTG1P22-201ENST00000603793 1099 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
TLR1Q15399 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
TLR1Q15399 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TLR1Q15399 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TLR1Q15399 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TLR1Q15399 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TLR1Q15399 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TLR1Q15399 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TLR1Q15399 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TLR1Q15399 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TLR1Q15399 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TLR1Q15399 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TLR1Q15399 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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