Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF5Q13243 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
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