Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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