Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE4BQ07343 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms