Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPN11Q06124 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms