Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms