Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP2C1P98194 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms