Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 MRPS31P4-202ENST00000613769 583 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 LINC01398-202ENST00000634819 1292 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 WNT8A-202ENST00000398754 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 AL031590.1-202ENST00000641466 1737 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 CMTM5-204ENST00000382809 378 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 AP002495.1-205ENST00000529513 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 C3orf84-203ENST00000545770 706 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 EEF1AKMT3-203ENST00000548256 561 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 ABCD1P3-201ENST00000562927 605 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 SEPT4-AS1-203ENST00000580769 1000 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 AL591499.1-201ENST00000307155 1153 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 LINC00388-201ENST00000412714 663 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 BX088651.3-201ENST00000418155 352 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 AP005273.1-201ENST00000444862 522 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 AL353653.1-201ENST00000452336 638 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 AC139493.2-202ENST00000510155 544 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 CSRP2-207ENST00000552330 910 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 LIMD2-210ENST00000582055 509 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 NAT9-219ENST00000582524 573 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 AC003070.1-201ENST00000592389 457 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 GOSR2-209ENST00000575949 1444 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMARCA2P51531 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 CYP4F29P-202ENST00000428301 1279 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 PLA2G6-210ENST00000435484 612 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 SRD5A3-AS1-203ENST00000591915 709 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 MYC-206ENST00000613283 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 ELP4-223ENST00000640342 1392 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 CKAP2-202ENST00000378034 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 GAST-201ENST00000329402 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 SULT1A3-201ENST00000338971 1097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 CRYZL1-205ENST00000399442 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 LINC02026-202ENST00000414309 772 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 AC010997.2-201ENST00000427610 260 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 AL513165.2-203ENST00000537239 717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 IDH3A-213ENST00000559205 566 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 PCTP-206ENST00000573500 919 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 AC022001.3-201ENST00000606330 596 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA2P51531 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms