Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNNI2P48788 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms