Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FDFT1P37268 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms