Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFNP31947 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFNP31947 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFNP31947 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFNP31947 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFNP31947 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFNP31947 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SFNP31947 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFNP31947 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFNP31947 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFNP31947 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFNP31947 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFNP31947 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFNP31947 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFNP31947 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFNP31947 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFNP31947 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFNP31947 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFNP31947 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFNP31947 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFNP31947 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFNP31947 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFNP31947 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFNP31947 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFNP31947 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFNP31947 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFNP31947 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SFNP31947 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFNP31947 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFNP31947 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SFNP31947 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFNP31947 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFNP31947 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFNP31947 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFNP31947 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFNP31947 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFNP31947 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFNP31947 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFNP31947 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFNP31947 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFNP31947 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFNP31947 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFNP31947 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFNP31947 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFNP31947 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFNP31947 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFNP31947 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFNP31947 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFNP31947 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFNP31947 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFNP31947 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFNP31947 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFNP31947 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFNP31947 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFNP31947 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFNP31947 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFNP31947 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFNP31947 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFNP31947 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFNP31947 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFNP31947 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFNP31947 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFNP31947 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFNP31947 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFNP31947 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFNP31947 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFNP31947 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFNP31947 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SFNP31947 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFNP31947 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFNP31947 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFNP31947 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFNP31947 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFNP31947 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFNP31947 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFNP31947 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFNP31947 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFNP31947 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFNP31947 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SFNP31947 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SFNP31947 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFNP31947 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFNP31947 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFNP31947 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFNP31947 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SFNP31947 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SFNP31947 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SFNP31947 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFNP31947 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFNP31947 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFNP31947 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFNP31947 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFNP31947 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFNP31947 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFNP31947 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFNP31947 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFNP31947 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFNP31947 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFNP31947 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFNP31947 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms