Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTSSP25774 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTSSP25774 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTSSP25774 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTSSP25774 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CTSSP25774 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CTSSP25774 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTSSP25774 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTSSP25774 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTSSP25774 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CTSSP25774 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CTSSP25774 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTSSP25774 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTSSP25774 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTSSP25774 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTSSP25774 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTSSP25774 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTSSP25774 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTSSP25774 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTSSP25774 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTSSP25774 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTSSP25774 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CTSSP25774 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms