Protein–RNA interactions for Protein: P0C1Z6

TFPT, TCF3 fusion partner, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFPTP0C1Z6 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TFPTP0C1Z6 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms