Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNAP02545 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNAP02545 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNAP02545 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNAP02545 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNAP02545 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNAP02545 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNAP02545 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNAP02545 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNAP02545 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNAP02545 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNAP02545 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNAP02545 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNAP02545 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNAP02545 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNAP02545 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNAP02545 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNAP02545 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNAP02545 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNAP02545 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNAP02545 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNAP02545 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNAP02545 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNAP02545 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNAP02545 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNAP02545 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNAP02545 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNAP02545 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNAP02545 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNAP02545 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNAP02545 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMNAP02545 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNAP02545 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNAP02545 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNAP02545 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNAP02545 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNAP02545 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNAP02545 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNAP02545 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNAP02545 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNAP02545 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNAP02545 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNAP02545 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNAP02545 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNAP02545 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNAP02545 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNAP02545 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNAP02545 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNAP02545 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNAP02545 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNAP02545 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNAP02545 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNAP02545 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNAP02545 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNAP02545 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNAP02545 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNAP02545 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNAP02545 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNAP02545 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNAP02545 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNAP02545 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNAP02545 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNAP02545 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNAP02545 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNAP02545 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNAP02545 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNAP02545 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNAP02545 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNAP02545 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNAP02545 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNAP02545 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNAP02545 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNAP02545 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNAP02545 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNAP02545 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNAP02545 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNAP02545 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNAP02545 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNAP02545 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNAP02545 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNAP02545 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNAP02545 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMNAP02545 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNAP02545 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNAP02545 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNAP02545 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNAP02545 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNAP02545 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNAP02545 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNAP02545 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNAP02545 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNAP02545 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNAP02545 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNAP02545 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNAP02545 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNAP02545 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNAP02545 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNAP02545 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNAP02545 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNAP02545 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms