Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
HOXA3O43365 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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