Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GOLGA8SH3BPF8 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GOLGA8SH3BPF8 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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