Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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