Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHPF2Q9P2E5 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms