Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHST12Q9NRB3 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms