Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM4Q9C037 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM4Q9C037 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM4Q9C037 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM4Q9C037 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM4Q9C037 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM4Q9C037 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM4Q9C037 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM4Q9C037 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM4Q9C037 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM4Q9C037 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM4Q9C037 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM4Q9C037 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM4Q9C037 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM4Q9C037 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM4Q9C037 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM4Q9C037 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM4Q9C037 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM4Q9C037 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM4Q9C037 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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TRIM4Q9C037 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM4Q9C037 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRIM4Q9C037 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM4Q9C037 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM4Q9C037 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM4Q9C037 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM4Q9C037 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM4Q9C037 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM4Q9C037 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM4Q9C037 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM4Q9C037 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRIM4Q9C037 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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TRIM4Q9C037 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TRIM4Q9C037 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM4Q9C037 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TRIM4Q9C037 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM4Q9C037 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM4Q9C037 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRIM4Q9C037 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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