Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF3

CECR2, Cat eye syndrome critical region protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CECR2Q9BXF3 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 NR2C2AP-201ENST00000331552 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 KRTAP1-5-201ENST00000361883 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 DNM1P48-201ENST00000419538 439 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 NR2C2AP-202ENST00000420605 859 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 C3orf84-201ENST00000432035 669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 AL139317.2-201ENST00000556998 158 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 HORMAD1-202ENST00000361824 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 POP5-201ENST00000341039 913 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 SPTLC1P3-201ENST00000403408 259 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 RN7SL794P-201ENST00000469816 280 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 WNT8A-202ENST00000398754 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 FUNDC1-201ENST00000378045 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 IGHV3-11-201ENST00000390601 473 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 PPP1R2P10-201ENST00000393023 595 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 AL512328.1-203ENST00000428480 673 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 AL358215.1-201ENST00000481350 482 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 GIMAP6-202ENST00000493969 876 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 AC233724.9-201ENST00000511694 407 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 AL136298.3-201ENST00000556746 445 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 AC009119.3-202ENST00000566773 196 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 ELP4-223ENST00000640342 1392 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 AL590399.1-204ENST00000430302 781 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 C10orf90-207ENST00000480379 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 HNRNPA1P72-201ENST00000529511 967 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CECR2Q9BXF3 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CECR2Q9BXF3 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CECR2Q9BXF3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CECR2Q9BXF3 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CECR2Q9BXF3 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CECR2Q9BXF3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CECR2Q9BXF3 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CECR2Q9BXF3 LYPLA1-202ENST00000343231 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CECR2Q9BXF3 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CECR2Q9BXF3 RNF170-202ENST00000319073 1265 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CECR2Q9BXF3 DUX4L31-201ENST00000446466 1136 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CECR2Q9BXF3 CSRP2-207ENST00000552330 910 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CECR2Q9BXF3 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CECR2Q9BXF3 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CECR2Q9BXF3 COG6-212ENST00000630730 186 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CECR2Q9BXF3 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CECR2Q9BXF3 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CECR2Q9BXF3 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CECR2Q9BXF3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CECR2Q9BXF3 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CECR2Q9BXF3 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CECR2Q9BXF3 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms