Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SGF29Q96ES7 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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SGF29Q96ES7 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SGF29Q96ES7 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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SGF29Q96ES7 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SGF29Q96ES7 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGF29Q96ES7 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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