Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

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Length 1,004 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HPS3Q969F9 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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