Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

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Length 740 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRRN4Q8WUT4 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRRN4Q8WUT4 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRRN4Q8WUT4 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRRN4Q8WUT4 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRRN4Q8WUT4 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRRN4Q8WUT4 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRRN4Q8WUT4 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRRN4Q8WUT4 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRRN4Q8WUT4 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRRN4Q8WUT4 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LRRN4Q8WUT4 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRRN4Q8WUT4 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRRN4Q8WUT4 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 CBR3-AS1-213ENST00000623647 815 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRN4Q8WUT4 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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