Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4Q7

CNNM4, Metal transporter CNNM4, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM4Q6P4Q7 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNNM4Q6P4Q7 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms