Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms